Тут трудно сказать, т.к. Вы с программой работаете в демо-режиме, почитайте в инструкции какие полномочия есть у пользователя user.
1. Логин/пароль при входе в программу ограничивает функциональность самой программы, у счётчиков свои пароли (те которые Вы правильно не трогали) для ограничения Ваших действий. Для конфигурирования счётчика Вам нужно подключаться как Лаборатория/Управление, прочитать существующая конфигурацию, поправить её как Вам нужно и залить обратно. И здесь, как правило, энергопоставляющая организация ставит пароль и иногда его даже теряет потом. В любом случае не рекомендую менять конфигурацию без представителей энергопоставщика.
2-3. Часть ответа Выше - дело не в User, т.е. может и в user тоже, но к этому энергопоставляющая организация отношения не имеет. Ну и не видел, чтобы они ставили пароль на чтение. Плюс, если Альтаир работает, то это в большой мере говорит о том, что пароль на чтение не менялся, а если всё-таки менялся, то "Да - обязаны сообщить".
4. Ошибаетесь - cosem - это протокол обмена со счётчиком и он используется с любым каналом связи (оптопорт, 485, 232 - не важно).
Делаете всё так, просто мне кажется, что дело именно в user. Почему бы Вам просто не написать письмо в энергопоставляющую организацию с просьбой изменить некоторые параметры в конфигурации счётчика, их всё равно нужно будет приглашать.