Чтобы разобратся как правильно делать пояснительную записку со сквозной нумерацией и нумерацией по разделам достаточно в гугле задать поиск "Двойная нумерация в Word".
Там очень много прекрасно изложенного материала. Единственно что вам придется углубить свои знания по применению полей в Word.
Однако следует иметь ввиду, что из этих двух нумераций, скажем так, верхней сквозной и нижней по-разделу, одна всегда будет главной. А именно та, в которой применяются поля {page}.
Дело в том, что именно по этому полю происходит печать документа определенной страницы. Просто это следует учитывать при построении формул при двойной нумерации в Word, иначе получите неудобства при печати. Поэтому полем {page} следует делать сквозную нумерацию по всему документу, а по-разделу - применять для получения номера страницы формулы.
Однако использование двойной нумерации в Word имеет один небольшой недостаток. Документ с двойной нумерацией требует аккуратного использования, чтобы случайно не удалить скрытые поля, что очень сильно не нравится обычным пользователям. А разбираться во всех хитросплетениях MS Word обычный народ не любит.