G@S, По идее в КТП должен быть контур 4Ом (нейтраль трансформатора) у ДЕС контур 4Ом (нейтраль генератора), Если к ГШЗ (главная заземляющая шина) 4ой жилой кабеля присоединить оба этих контура то все будет в ажуре. Если есть возможность сделай общий контур для КТП, ДЭС и насосной (это будет аще зашибись, ПУЭ рекомендует делать именно так).
А на счет кабеля нужно смотреть паспорт ДЭС, я думаю, можно обойтись 4х жильным, а от ВРУ (АВР) насосной, если это требуется, подключаться 2(3)х и 4(5)ти жильными кабелями, в зависимости от оборудования